何亚文

姓名: 何亚文

职称: 特别研究员

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  • 个人简历:

    个人简介

    湖北黄梅人,1992年毕业于华中师范大学生物系;1995年于中国科学院华南植物研究所获植物生理学硕士学位;1995-1997年在中国科学院华南植物研究所工作,任助理研究员;1997年9月获新加坡政府奖学金,赴新加坡国立大学(National University of Singapore, NUS)留学,1999年9月获植物学硕士学位;1999年12月加入新加坡分子农业生物学院(Institute of Molecular Agrobiology),任Assistant Research Officer;2002年加入新加坡分子与细胞生物研究院(Institute of Molecular and Cell Biology, IMCB),任Junior Research Fellow,主要研究野油菜黄单胞菌和水稻白叶枯菌(Xanthomonas)群体感应(Quorum sensing)机理;2006年获NUS-IMCB联合培养理学博士学位(研究型),任分子与细胞生物研究院Research Fellow,从事黄单胞菌群体感应和低氧感应分子机理研究。2010年6月,加入上海交通大学生命科学技术学院,特别研究员,博导,微生物代谢国家重点实验室PI。

    教育经历

     

    2001.07-2006.10   新加坡分子与细胞生物学研究院   分子微生物学博士学位

    1997.09-1999.12   新加坡国立大学生物系           植物学硕士学位

    1992.09-1995.07   中科院华南植物研究所           植物生理学硕士学位

    1988.09-1992.09   华中师范大学生物系             生物学学士学位

    工作经历

     

    2010.06 -       上海交通大学生命科学技术学院 研究员 博导

    2006.10-2010.05 Institute of Molecular and Cell Biology (IMCB) Research Fellow

    2001.07-2006.09 IMCB Junior Research Fellow

    1999.12-2001.06 Institute of Molecular Agrobiology Assistant Research Officer

    1995.08-1997.08 中科院华南植物研究所    助理研究员


     

     

     

     

     

     

  • 1.         黄单胞菌群体感应机理及其基因表达调控网络

    2.         黄单胞菌与植物之间通过小分子信号互作的分子机制

    3.        植物根际促生菌功能基因组学和新型微生物源绿色农药研发

  • 1. Zhou L, Wang JY, Wang J, Poplawsky A, Lin S, Zhu B, Chang C, Zhou T, Zhang LH, He YW*. The diffusible factor (DF) synthase XanB2 is a bifunctional chorismatase that links the shikimate pathway to ubiquinone and xanthomonadins biosynthetic pathways. Mol Microbiol, 2013, 87(1):80-93.

    2. Wu DQ, Ye J, Ou HY, Wei X, Huang X, He YW* and Xu Y*. Genomic analysis and temperature-dependent transcriptome profiles of the rhizosphere originating strain Pseudomonas aeruginosa M18.  BMC Genomics, 2011, 12:438.
    3. Zhou L, Vorholter FJ, He YQ, Jiang BL, Tang JL, Xu Y, Puhler A, He YW*. Gene discovery by genome-wide CDS re-prediction and microarray-based transcriptional analysis in phytopathogen Xanthomonas campestris. BMC Genomics, 2011, 12(1):359.
    4. He YW*, Wu J, Zhou L, Yang F, Jiang BL, Tang JL, Bai L, Xu Y, Deng Z, Zhang LH*. Xanthomonas campestris diffusible factor is 3-hydroxybenzoic acid and associated with xanthomonadin biosynthesis, cell viability, antioxidant activity and systemic invasion. Mol Plant Microbe Interact, 2011, 24(8):948-57. 
    5. He YW*, Wu JE, Cha JS, Zhang LH*. Rice bacterial blight pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae produces multiple DSF-family signals in regulation of virulence factor production. BMC Microbiol, 2010, 10:187. 
    6. Cheng Z†, He YW†, Lim SC†, Qamra R†, Walsh MA, Zhang LH, Song H Structural basis of the sensor-synthase interaction in autoinduction of the quorum sensing signal DSF biosynthesis. Structure, 2010, 18(9):1199-1209
    7. He YW, Boon C, Zhou L, Zhang LH. Co-regulation of Xanthomonas campestris virulence by quorum sensing and a novel two-component regulatory system RavS/RavR. Mol Microbiol, 2009, 71(6):1464-1476. 
    8. He YW, Zhang LH. Quorum Sensing and Virulence Regulation in Xanthomonas campestris. FEMS Microbiol Rev, 2008, 32(5):842-57. 
    9. He YW, Ng YJ, Xu M, Lin K and Zhang LH. Xanthomonas campestris cell-cell communication involves a nucleotide receptor protein Clp and a hierarchical signaling network. Mol Microbiol, 2007, 64(2):281-292. 
    10. He YW, Wang C, Zhou L, Song H, Dow JM, Zhang LH. Dual signaling functions of the hybrid sensor kinase RpfC of Xanthomonas campestris involve either phosphorelay or receiver domain-protein interaction. J Biol Chem, 2006, 281(44):33414-21.
    11. Ryan RP, Fouhy Y, Lucey JF, Crossman LC, Spiro S, He YW, Zhang LH, Heeb S, Camara M, Williams P, Dow JM. Cell-cell signaling in Xanthomonas campestris  involves  an  HD-GYP  domain  protein  that  functions  in cyclic di-GMP turnover. Proc Natl Acad Sci U S A,  2006, 103(17):6712-7. 
    12.He YW, Xu M, Lin K, Ng YJ, Wen CM, Wang LH, Liu ZD, Zhang HB, Dong YH, Dow JM and Zhang LH. Genome scale analysis of diffusible signal factor regulon in Xanthomonas campestris pv. campestris: identification of novel cell-cell communication-dependent genes and functions. Mol Microbiol, 2006, 59(2):610-622.