微生物代谢国家重点实验室学术交流例会2022-09

报告题目一:抗肿瘤药物链黑菌素的生物合成

报告人: 林双君  特聘教授

报告摘要:

链黑菌素是由绒毛链霉菌产生的含有四环多官能团的生物碱,具有广谱且显著的抗肿瘤活性,尤其对急性白血病、恶性淋巴瘤及其他骨髓增生性疾病均有较好的疗效。链黑霉素抑制肿瘤的机制有多种,可通过抑制DNA和RNA的生物合成,诱导DNA单链或双链断裂,促使DNA非程序化合成以及与DNA形成复合体,抑制DNA拓扑异构酶II等。

通过代谢物分析,确定了一个含有48个基因的基因簇,利用一系列生化研究,揭示了前体物β-甲基色氨酸和β-咔啉生物碱形成的酶学机制,以及后修饰过程的羟基化和甲基化反应时序,基本上建立了链黑菌素的生物合成途径。并发现了一个特殊的保护机制,即通过四个羧甲基转移酶保护吡啶羧酸结构以及产物的外排机制。此外,还发现了一个新颖的启动子,明确了其结构及工作强度,可高效地实现多个链霉菌次级代谢物的异源合成。通过基因敲除产生了一系列链黑菌素衍生物,其中某些衍生物具有更好的活性,为新药筛选提供化合物资源。

 

报告题目二:核酸表观遗传修饰的组学分析

报告人: 曹博  长聘教轨副教授

报告摘要:

细胞内的核酸大分子除了碱基序列作为基本遗传密码之外,还通常含有丰富多样的化学修饰。这些修饰作为另一层次的遗传密码,通过精准调控基因表达网络决定着诸多重要的生物学过程,被称为表观遗传修饰。目前已知的DNA和RNA修饰类型分别超过50和170种,且广泛分布于原核和真核生物。围绕核酸修饰的研究促进了表观基因组学和表观转录组学研究领域的建立和发展,是近年来生命科学领域的前沿热点之一。

报告人围绕核酸表观修饰领域取得了系列进展:在DNA方面开发了ICDS-seq、Nick-seq等DNA组学研究新技术,利用这些技术解析破译了微生物中DNA多个表观修饰的分布图谱,揭示了DNA磷硫酰化修饰的生物合成过程、代谢规律以及生理学功能,并发现了不同表观修饰之间相互作用的生物学新现象;在RNA方面开发了AQRNA-seq技术,突破了传统RNA-seq技术无法检测含有修饰的RNA的技术瓶颈,为RNA修饰组学高通量分析奠定了基础。近期,围绕含有高度修饰的tRNA分子,在系统解析其基因表达规律、调控性衍生片段(tRFs)的生成、修饰分布图谱以及修饰的资源挖掘方面取得了系列进展。

 

主持人:梁如冰 教授

时   间:2022年9月28日(周三)  上午10:00-11:10

地    点:腾讯会议

会议号:856 342 334

会议密码: 220928

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