微生物代谢是探索微生物代谢途径功能和调控机制、揭示微生物与环境互作的代谢规律、优化或重塑生物性状并加以充分利用的科学技术体系，为破解复杂生命现象奠定基础，为人类健康和生物产业提供不竭的技术和资源。

探微知著，智拓新境。微生物代谢全国重点实验室坚持面向国家重大战略需求，紧扣“微生物代谢的分子基础、动态调控与多维互作规律”核心科学问题，发展网络化、动态化、系统化的研究新范式，聚焦新型初级代谢及其调控、次级代谢规模发现与机制、代谢互作全景图、代谢系统智能重塑等四大研究方向，铺就生命奥秘的探索之路，攀登产业跃升的革新之阶。

筚路蓝缕，薪火相传。其前身是2011年成立的“微生物代谢国家重点实验室”，2025年顺利重组。十五载深耕不辍，秉持"博学、求新、敬业、融洽"理念，汇聚院士领衔的顶尖团队，形成2支国家基金委创新群体，在微生物表观修饰、天然产物合成、微生物群系与健康、极端环境微生物、代谢重塑与合成生物学、环境微生物代谢等领域，取得了具有国际影响力的理论创新与技术突破，在全球工业微生物学、人类微生物组、溟渊计划等国际合作中发挥着日益重要的影响。

使命在肩，砥砺前行。实验室以解析生命密码，驱动代谢潜能为愿景，践行"顶天立地"科研理念，将为全球生命健康、绿色发展提供中国方案，谱写造福人类的壮美华章。