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Nature | 本室唐鸿志团队合作取得人工设计构建复合有机污染降解菌株新突破
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重磅突破！全重室团队全球首绘海洋最深生态系统图 深渊生命研究领跑国际前沿
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通知公告
bulletins
2026年开放课题申请通知
2026-01-29
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2025年微生物科学技术夏令营通知
2025-06-01
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实验室新闻
Laboratory News
祝贺！微生物代谢全国重点实验室两个团队入选上海交通大学第七届“十大科技进展”
2026-07-23
2026年微生物科学技术夏令营通知
2026-06-29
西班牙国家研究委员会代表团访问本室
2026-04-14
微生物代谢全国重点实验室合成生物学术研讨会顺利召开
2025-10-29
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学术活动
Academic activities
“汇聚顶尖智慧，引领科技前沿，服务国家战略，共筑创新未来” ——为科技强国注入无限动能
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-06
2026年5月27日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-05
2026年5月27日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
详细了解
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-05
2026年5月11日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-04
2026年4月14日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-03
2026年3月23日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2025-11
2025年11月13日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2025-10-Ⅱ
2025年10月21日 10:00-11:10
会议时间
上海交通大学闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2025-10-Ⅰ
2025年10月9日 10:00-11:10
会议时间
上海交通大学闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
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【第三十九讲】环境微生物领域知名学者 Frank E. Löffler 教授作客启智讲坛
Prof. Frank E. Loffler
报告人
美国田纳西大学土木与环境工程系Goodrich卓越讲席教授，美国微生物科学院院士。德国霍恩海姆大学学士、硕士，汉...
简介
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【第三十九讲】美国田纳西大学Frank E. Loffler教授做客启智讲坛
Prof. Frank E. Loffler
报告人
美国田纳西大学土木与环境工程系Goodrich卓越讲席教授，美国微生物科学院院士。德国霍恩海姆大学学士、硕士，汉...
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【第三十四讲】日本神户大学Akihiko Kondo教授做客启智讲坛
Prof. Akihiko Kondo
报告人
Akihiko Kondo，神户大学副校长，神户大学科学技术与创新研究生院院长，神户大学化学科学与工程系教授，理化学研究...
简介
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【第三十三讲】韩国科学技术院、韩国国家工程院院士SangYupLee教授做客启智讲坛
Prof. Sang Yup Lee
报告人
Sang Yup Lee是韩国科学技术院（KAIST）化学与生物分子工程系特聘教授，现任主管科研的副校长、生物过程工程研究...
简介
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【第三十二讲】伊利诺伊大学香槟分校教授 Huimin Zhao做客启智讲坛
Prof. Huimin Zhao
报告人
赵惠民教授是伊利诺伊大学香槟分校（UIUC）化学和生物分子工程的Steven L. Miller讲席教授，美国国家科学基金人工...
简介
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微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-06
2026年5月27日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-05
2026年5月27日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-05
2026年5月11日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-04
2026年4月14日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2026-03
2026年3月23日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2025-11
2025年11月13日 10:00
会议时间
闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2025-10-Ⅱ
2025年10月21日 10:00-11:10
会议时间
上海交通大学闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
微生物代谢全国重点实验室学术交流例会2025-10-Ⅰ
2025年10月9日 10:00-11:10
会议时间
上海交通大学闵行校区生物药学楼一楼报告厅
会议地点
【第三十九讲】环境微生物领域知名学者 Frank E. Löffler 教授作客启智讲坛
Prof. Frank E. Loffler
报告人
主持人
【第三十九讲】美国田纳西大学Frank E. Loffler教授做客启智讲坛
Prof. Frank E. Loffler
报告人
主持人
【第三十四讲】日本神户大学Akihiko Kondo教授做客启智讲坛
Prof. Akihiko Kondo
报告人
主持人
【第三十三讲】韩国科学技术院、韩国国家工程院院士SangYupLee教授做客启智讲坛
Prof. Sang Yup Lee
报告人
许平 教授
主持人
【第三十二讲】伊利诺伊大学香槟分校教授 Huimin Zhao做客启智讲坛
Prof. Huimin Zhao
报告人
主持人
科研进展
Research Progress
实验室面向微生物代谢科学前沿和产业重大需求，探索微生物合成与分解代谢的机理
科研进展 | 开发新工具AlphaGEM，为非模式生物绘制精准“代谢地图”
2026-07-20
近日，微生物代谢全国重点实验室鲁洪中课题组在国际期刊 《Nature Communications》发表了题为 “AlphaGEM Enables Precise Genome-Scale Metabolic Modelling by Integrating Protein Structure Alignment with Deep-learning-based Dark Metabolism Mining”的研究论文。该研究开发了自动化基因组规模代谢模型构建工具AlphaGEM。该工具创新性地整合了蛋白质三维结构比对、蛋白语言模型和深度学习功能注释，成功实现了跨真菌、细菌和哺乳动物的高质量、高通量代谢模型自动重构。AlphaFold初步解决了蛋白质3D结构预测的问题，AlphaGEM的推出则将非模式物种基因组规模代谢模型（ GEMs）的高质量重构向前推进了一大步。上海交通大学博士生韩伟赏、肖陆驰与本科毕业生孙浩成为该论文共同第一作者，鲁洪中副教授为唯一通讯作者，本室为第一通讯单位。
科研进展 | 解锁新型茴香霉素衍生物合成新路径
2026-07-06
近日，微生物代谢全国重点实验室由德林团队在《ACS Catalysis》上发表了题为“Engineering O-methyltransferase for the biocatalytic synthesis of ribosome-targeting anisomycin derivatives” 的研究论文。该研究聚焦农用抗生素茴香霉素生物合成途径中的后期修饰环节，以O -甲基转移酶AniK为改造靶点，创新性地将结构指导理性设计与人工智能辅助计算筛选相结合，实现了酶分子的高效定向进化。同时，依托自主结构生成算法 DELETE 设计了全新的衍生物骨架，并结合一锅多酶级联催化体系，成功合成了14种茴香霉素衍生物。这一成果为核糖体靶向类茴香霉素化合物的精准结构衍生化开辟了全新技术策略。上海交通大学博士研究生林百欣和李思远为共同第一作者，孔令新副研究员与由德林教授为共同通讯作者，本室为第一通讯单位。
科研进展 | 微生物细胞工厂耦合新型光生物催化实现D-高色氨酸的从头合成
2026-06-16
近日，微生物代谢全国重点实验室鲁洪中团队和南京大学黄小强团队联合在国际期刊《Nature Communications》发表了题为“Integrating microbial cell factory with new-to-nature photobiocatalysis for de novo biosynthesis of D-homotryptophan”的研究论文。该研究创新性地将微生物细胞工厂与非天然光生物催化反应相整合，通过模块化设计策略，成功构建了光驱动微生物细胞工厂，实现了非天然氨基酸D-高色氨酸的从头合成。这一成果为未来非天然产物的生物制造提供了全新平台。南京大学博士研究生郭之旗和上海交通大学博士研究生高庚荣为论文的共同第一作者，黄小强教授与鲁洪中副教授为共同通讯作者，本室为第二通讯单位。
科研进展 | 开发基于单Cas13效应子的原核多功能基因表达调控平台SONAR
2026-06-01
近日，微生物代谢全国重点实验室童垚俊团队在《Nature Biotechnology》期刊上发表了题为“Programmable, multiplexed and orthogonal gene control in bacteria with attenuated Cas13d systems”的研究论文。同期还以Research Briefing的形式对该工作进行了题为“Revolutionizing biotechnology advances natural products discovery and industrial processing”的报道。该研究创新性地提出“活性-特异性-毒性”平衡策略，首次为原核生物开发了基于单一Cas13d效应子的多功能RNA调控平台——SONAR，使同一个Cas13d框架能够根据crRNA设计分别执行转录本降解、翻译抑制和翻译激活任务。上海交通大学博士研究生童圣坤为论文第一作者，童垚俊为唯一通讯作者，本室为第一通讯单位。
科研进展 | 揭示细菌防御系统DdmDE清除质粒的动力学分子机制
2026-06-01
近日，微生物代谢全国重点实验室冯雁团队和上海科技大学孙博、孙亚东团队联合在国际期刊《Molecular Cell》发表了题为“The DdmDE defense system eradicates plasmids by target-centered bidirectional ssDNA loop extrusion and site-specific cleavage”的研究论文。该研究通过单分子操纵、共聚焦成像、结构预测与生物化学等实验手段，系统性地解析了细菌防御系统DdmDE识别并清除外源质粒的动力学分子机制。上海交通大学博士生杨昊及上海科技大学博士生宋晓萱、赵家铮为论文的共同第一作者，冯雁教授与上海科技大学孙博教授、孙亚东教授为共同通讯作者。
科研进展 | 开发酶约束代谢模型智能优化新框架EnzymeTuning，提升跨物种蛋白质丰度预测精准度
2026-05-29
近日，微生物代谢全国重点实验室鲁洪中副教授与华东理工大学生物反应器工程全国重点实验室王冠副教授合作在国际期刊《Nature Communications》发表了题为"EnzymeTuning Improves Enzyme-constrained Metabolic Modeling and Proteome Abundance Prediction Through Deep Learning"的研究论文。该研究创新性地提出了名为EnzymeTuning的计算框架，率先将生成对抗网络（GAN）引入酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs）的全局优化，为构建高精度的"数字细胞"提供了新方法。上海交通大学与华东理工大学联合培养博士生王雪婷为论文第一作者，鲁洪中副教授与华东理工大学王冠副教授为共同通讯作者。
科研进展 | 邓子新团队揭示寡糖抗生素糖霉素A硫酸化修饰机制
2026-05-26
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队丁伟课题组和江西师范大学张琪课题组联合在 《JACS Au》 发表了题为 “Sulfation in the Biosynthesis of the Heptadecaglycoside Antibiotic Saccharomicin A” 的研究论文。该研究成功鉴定了寡糖抗生素“糖霉素A”生物合成中的关键硫酸转移酶Sam10，并阐明了PAPS供体供应相关酶Sam35的重要作用，为开发抗耐药菌的新型抗生素提供了重要的酶学工具与理论基础。上海交通大学曹阳为论文第一作者，丁伟副教授和江西师范大学张琪教授为论文通讯作者，微生物代谢全国重点实验室为第一通讯单位。
科研进展 | 分解代谢根际分泌物—揭示根际微生物损害植物生长的机制
2026-05-19
近日，微生物代谢全国重点实验室周宁一教授团队在《Nature Communications》上发表题为“Rhizobacteria opportunistically boost colonization and impair plant fitness by degrading plant-derived coumarins under iron deficiency”的研究论文。上海交通大学毕业博士研究生顾怡超为论文第一作者，周宁一特聘教授为通讯作者，本室为第一通讯单位。
科研进展 | 核糖体肽生物合成中新化学─ADP-核糖基化
2026-03-25
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队丁伟课题组和江西师范大学张琪课题组联合在《PNAS》上发表题为“A ribosomally synthesized and posttranslationally modified peptide with ADP-ribosylation”的研究论文。该研究首次发现了一种新型核糖体合成并经翻译后修饰肽（RiPP）天然产物— minviopeptin，并开创性地揭示 ADP-核糖基化可作为RiPP生物合成过程中的内源性关键步骤。研究解析了由自由基SAM酶、ADP-核糖基转移酶和α-酮戊二酸依赖非血红素铁酶协同驱动的全新修饰级联反应，显著拓展了天然产物生物合成的酶学与化学空间。上海交通大学郭思佳为论文第一作者，丁伟副教授和江西师范大学的张琪教授为共同通讯作者，微生物代谢全国重点实验室为第一通讯单位。
科研进展 | 以效率换保真度：揭示NRPS催化通道的进化策略
2026-03-24
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队汪志军课题组在《Nature Synthesis》发表题为“Analysis of heterocycle formation and stereochemical control by a nonribosomal peptide synthetase condensation domain”的研究论文。上海交通大学曹卫博士、王嘉良博士和硕士生陈学乐为该论文共同第一作者，汪志军研究员为通讯作者，本室为第一单位。
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杰出人才
Distinguished Talents
实验室面向国家重大战略需求，秉承“博学、求新、敬业、融洽”理念，汇聚一批 治学严谨、学
术造诣深厚的高层次人才，服务高水平科技自立自强，助力实现“科技强国”战略目标。
邓子新
讲席教授
张雁
特聘教授
钟建江
特聘教授
肖湘
讲席研究员
林双君
特聘教授
林厚文
特聘教授
杨琛
特聘教授
史卫峰
特聘研究员
瞿旭东
教授
唐鸿志
长聘教授
刘天罡
特聘教授
游淳
特聘教授
许平
特聘教授
史贤明
教授
魏冬青
长聘教授
冯雁
特聘教授
白凤武
特聘教授
白林泉
长聘教授
施春雷
教授
薛小莉
研究员
曹博
研究员
全舒
教授
谭在高
长聘教轨副教授
汤志军
长聘教轨副教授
王寅炤
长聘教轨副教授
谢志平
研究员
熊毅
副研究员
戴少波
长聘教轨副教授
张晨虹
研究员
孔旭东
长聘教轨副教授
刘昱
长聘副教授
肖华
教授
肖毅
长聘副教授
郑舰艇
长聘副教授
陈光玉
长聘教轨副教授
胡泽汗
长聘教轨副教授
李雷
长聘教轨副教授
秦伯阳
长聘教轨副教授
童垚俊
长聘教轨副教授
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