曹博
Bo Cao
研究员
博士生导师
研究重点：
RNA表观修饰与调控
围绕DNA和RNA大分子上的表观遗传修饰与调控领域，聚焦开发核酸组学研究新技术，破译表观调控系统及其未知生理功能，应用于发掘临床中遗传病、肿瘤发生发展、代谢性疾病等过程的新型分子靶标，并针对新靶标设计开发表观修饰编辑工具以及新型核酸药物等。主要科研成果发表在 Nat. Biotech., Nat. Commun., Nucl. Acid. Res., PNAS, Angewandte Chemie International Ed 等国际期刊上，开发的新型分子检测技术分别获得授权中美专利共6项。作为负责人承担国家自然科学基金委优青项目、面上项目、科技部重点专项子课题等多项。现任上海生物化学与分子生物学会常务理事。
教育经历
Educational experience
2012.12–2014.01 美国麻省理工学院，生物工程，联合博士生
2008.09–2014.11上海交通大学，生物学博士
2004.09–2008.07广西大学，生物技术，学士
工作经历
Work experience
2022.03-至今 上海交通大学生命科学技术学院, 教授
2019.04–2021.12 曲阜师范大学生命科学学院，教授
2018.04–2019.04新加坡-麻省理工学院研究与技术联盟（SMART研究所），Research Scientist
2015.04–2018.04 美国麻省理工学院，博士后
荣誉获奖
Honours and Awards
代表性论文
Representative works
1. Kaiser S, Byrne SR, Ammann G, Asadi Atoi P, Borland K, Brecheisen R, DeMott MS, Gehrke T, Hagelskamp F, Heiss M, Yoluc Y, Liu L, Zhang Q, Dedon PC, Cao B*, Kellner S*. Strategies to avoid artifacts in mass spectrometry-based epitranscriptome analyses. Angew Chem Int Ed Engl. 2021 Aug 2. doi: 10.1002/anie.202106215.
2. Hu J, Yim D, Ma D, Huber MS, Davis N, Bacusmo JM, Vermeulen S, Zhou J, Begley TJ, DeMott MS, Levine SS, Crécy-Lagard V, Dedon PC*, Cao B*. Quantitative mapping of the cellular small RNA landscape with AQRNAseq. Nat. Biotech. 2021 Apr 15. doi: 10.1038/s41587-021-00874-y
3. Cao B*#, Wu X#, Zhou J, Wu H, Liu L, Zhang Q, DeMott MS, Gu C, Wang L, You D*, Dedon PC*, Nick-seq for single-nucleotide resolution genomic maps of DNA modifications and damage, Nucleic Acids Res. 2020, 48(12), 6715–6725 5.
4. Wu X#, Cao B#, Aquino P, Chiu TP, Chen C, Jiang S, Deng Z, Chen S, Rohs R, Wang L, Galagan JE, Dedon PC*. Epigenetic competition reveals density-dependent regulation and target site plasticity of phosphorothioate epigenetics in bacteria. Proc Natl Acad Sci USA. 2020. Jun 23;117(25):14322-14330.
5. Cao B #, Chen C#, DeMott MS, Cheng Q, Clark TA, Xiong X, Zheng X, Butty V, Levine SS, Yuan G, Boitano M, Luong K, Song Y, Zhou X, Deng Z, Turner SW, Korlach J, You D, Wang L, Chen S, Dedon PC. Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences. Nat Commun. 2014, 5, 3951.
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