科研进展 | 开发基于单Cas13效应子的原核多功能基因表达调控平台SONAR
近日，微生物代谢全国重点实验室童垚俊团队在《Nature Biotechnology》期刊上发表了题为“Programmable, multiplexed and orthogonal gene control in bacteria with attenuated Cas13d systems”的研究论文。同期还以Research Briefing的形式对该工作进行了题为“Revolutionizing biotechnology advances natural products discovery and industrial processing”的报道。该研究创新性地提出“活性-特异性-毒性”平衡策略，首次为原核生物开发了基于单一Cas13d效应子的多功能RNA调控平台——SONAR，使同一个Cas13d框架能够根据crRNA设计分别执行转录本降解、翻译抑制和翻译激活任务。上海交通大学博士研究生童圣坤为论文第一作者，童垚俊为唯一通讯作者，本室为第一通讯单位。
06-01
2026
科研进展 | 揭示细菌防御系统DdmDE清除质粒的动力学分子机制
近日，微生物代谢全国重点实验室冯雁团队和上海科技大学孙博、孙亚东团队联合在国际期刊《Molecular Cell》发表了题为“The DdmDE defense system eradicates plasmids by target-centered bidirectional ssDNA loop extrusion and site-specific cleavage”的研究论文。该研究通过单分子操纵、共聚焦成像、结构预测与生物化学等实验手段，系统性地解析了细菌防御系统DdmDE识别并清除外源质粒的动力学分子机制。上海交通大学博士生杨昊及上海科技大学博士生宋晓萱、赵家铮为论文的共同第一作者，冯雁教授与上海科技大学孙博教授、孙亚东教授为共同通讯作者。
06-01
2026
科研进展 | 开发酶约束代谢模型智能优化新框架EnzymeTuning，提升跨物种蛋白质丰度预测精准度
近日，微生物代谢全国重点实验室鲁洪中副教授与华东理工大学生物反应器工程全国重点实验室王冠副教授合作在国际期刊《Nature Communications》发表了题为"EnzymeTuning Improves Enzyme-constrained Metabolic Modeling and Proteome Abundance Prediction Through Deep Learning"的研究论文。该研究创新性地提出了名为EnzymeTuning的计算框架，率先将生成对抗网络（GAN）引入酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs）的全局优化，为构建高精度的"数字细胞"提供了新方法。上海交通大学与华东理工大学联合培养博士生王雪婷为论文第一作者，鲁洪中副教授与华东理工大学王冠副教授为共同通讯作者。
05-29
2026
科研进展 | 邓子新团队揭示寡糖抗生素糖霉素A硫酸化修饰机制
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队丁伟课题组和江西师范大学张琪课题组联合在 《JACS Au》 发表了题为 “Sulfation in the Biosynthesis of the Heptadecaglycoside Antibiotic Saccharomicin A” 的研究论文。该研究成功鉴定了寡糖抗生素“糖霉素A”生物合成中的关键硫酸转移酶Sam10，并阐明了PAPS供体供应相关酶Sam35的重要作用，为开发抗耐药菌的新型抗生素提供了重要的酶学工具与理论基础。上海交通大学曹阳为论文第一作者，丁伟副教授和江西师范大学张琪教授为论文通讯作者，微生物代谢全国重点实验室为第一通讯单位。
05-26
2026
科研进展 | 分解代谢根际分泌物—揭示根际微生物损害植物生长的机制
近日，微生物代谢全国重点实验室周宁一教授团队在《Nature Communications》上发表题为“Rhizobacteria opportunistically boost colonization and impair plant fitness by degrading plant-derived coumarins under iron deficiency”的研究论文。上海交通大学毕业博士研究生顾怡超为论文第一作者，周宁一特聘教授为通讯作者，本室为第一通讯单位。
05-19
2026
