科研进展 | 开发酶约束代谢模型智能优化新框架EnzymeTuning，提升跨物种蛋白质丰度预测精准度
近日，微生物代谢全国重点实验室鲁洪中副教授与华东理工大学生物反应器工程全国重点实验室王冠副教授合作在国际期刊《Nature Communications》发表了题为"EnzymeTuning Improves Enzyme-constrained Metabolic Modeling and Proteome Abundance Prediction Through Deep Learning"的研究论文。该研究创新性地提出了名为EnzymeTuning的计算框架，率先将生成对抗网络（GAN）引入酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs）的全局优化，为构建高精度的"数字细胞"提供了新方法。上海交通大学与华东理工大学联合培养博士生王雪婷为论文第一作者，鲁洪中副教授与华东理工大学王冠副教授为共同通讯作者。
05-29
2026
科研进展 | 邓子新团队揭示寡糖抗生素糖霉素A硫酸化修饰机制
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队丁伟课题组和江西师范大学张琪课题组联合在 《JACS Au》 发表了题为 “Sulfation in the Biosynthesis of the Heptadecaglycoside Antibiotic Saccharomicin A” 的研究论文。该研究成功鉴定了寡糖抗生素“糖霉素A”生物合成中的关键硫酸转移酶Sam10，并阐明了PAPS供体供应相关酶Sam35的重要作用，为开发抗耐药菌的新型抗生素提供了重要的酶学工具与理论基础。上海交通大学曹阳为论文第一作者，丁伟副教授和江西师范大学张琪教授为论文通讯作者，微生物代谢全国重点实验室为第一通讯单位。
05-26
2026
科研进展 | 分解代谢根际分泌物—揭示根际微生物损害植物生长的机制
近日，微生物代谢全国重点实验室周宁一教授团队在《Nature Communications》上发表题为“Rhizobacteria opportunistically boost colonization and impair plant fitness by degrading plant-derived coumarins under iron deficiency”的研究论文。上海交通大学毕业博士研究生顾怡超为论文第一作者，周宁一特聘教授为通讯作者，本室为第一通讯单位。
05-19
2026
科研进展 | 核糖体肽生物合成中新化学─ADP-核糖基化
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队丁伟课题组和江西师范大学张琪课题组联合在《PNAS》上发表题为“A ribosomally synthesized and posttranslationally modified peptide with ADP-ribosylation”的研究论文。该研究首次发现了一种新型核糖体合成并经翻译后修饰肽（RiPP）天然产物— minviopeptin，并开创性地揭示 ADP-核糖基化可作为RiPP生物合成过程中的内源性关键步骤。研究解析了由自由基SAM酶、ADP-核糖基转移酶和α-酮戊二酸依赖非血红素铁酶协同驱动的全新修饰级联反应，显著拓展了天然产物生物合成的酶学与化学空间。上海交通大学郭思佳为论文第一作者，丁伟副教授和江西师范大学的张琪教授为共同通讯作者，微生物代谢全国重点实验室为第一通讯单位。
03-25
2026
科研进展 | 以效率换保真度：揭示NRPS催化通道的进化策略
近日，微生物代谢全国重点实验室邓子新院士团队汪志军课题组在《Nature Synthesis》发表题为“Analysis of heterocycle formation and stereochemical control by a nonribosomal peptide synthetase condensation domain”的研究论文。上海交通大学曹卫博士、王嘉良博士和硕士生陈学乐为该论文共同第一作者，汪志军研究员为通讯作者，本室为第一单位。
03-24
2026
