科研进展 | 揭示尿路细菌促肾结石的双重机制
近日，微生物代谢全国重点实验室刘然、刘天罡团队与武汉大学中南医院徐华、刘同族团队联合在国际期刊《Cell Host & Microbe》上发表了题为“Hippuric acid metabolism by Corynebacterium glucuronolyticum-like bacteria promotes calcium oxalate crystallization”的研究论文。该研究发现草酸钙结石患者尿液中显著富集一类解葡萄糖苷棒杆菌及其近缘种（Corynebacterium glucuronolyticum-like bacteria），并证实该类细菌可通过降解马尿酸和形成生物膜促进草酸钙结晶。进一步研究表明，补充马尿酸或摄入蔓越莓均可抑制由该类细菌驱动的草酸钙结晶过程，为基于微生物群的结石预防策略提供了全新思路。本室刘然副研究员、刘天罡教授和武汉大学中南医院徐华教授、刘同族教授为该论文共同通讯作者。
09-10
2026
科研进展 | 周宁一团队揭示合成菌群协同降解多溴联苯醚机制
近日，微生物代谢全国重点实验室周宁一团队在国际期刊《The ISME Journal》发表了题为“Metabolic interactions enable aerobic degradation of the environmental pollutant BDE-47”的研究论文。该论文首次解析了典型溴代阻燃剂2,2′,4,4′-四溴联苯醚（BDE-47）在合成菌群协同作用下的好氧降解机理，为阐明多溴联苯醚（PBDEs）在自然环境中的转化归趋及污染场地的生物修复提供了有效的策略支撑。上海交通大学博士生潘飘飘和特聘教授周宁一为论文作者。
09-01
2026
科研进展 | PLP酶平台实现γ-叔硝基非天然氨基酸的高效立体选择性合成
近日，微生物代谢全国重点实验室刘文、汤志军团队在国际期刊《Nature Communications》发表了题为“A pyridoxal phosphate-dependent enzyme platform for stereoselective synthesis of γ-tertiary-nitro-noncanonical amino acids”的研究论文。该研究通过反应设计、酶筛选与定向进化，发现了一个全新的PLP酶平台，成功实现了γ-叔硝基非天然氨基酸的高效立体选择性地合成。上海交通大学博士后丁文萍和博士后骆声淦为论文共同第一作者，刘文教授、汤志军副教授以及邹一可副教授为论文共同通讯作者，本室为第一通讯单位。
08-27
2026
科研进展 | 离散型聚酮合酶“烯基还原模块”的首次发现
近日，微生物代谢全国重点实验室与生命科学技术学院瞿旭东团队在国际期刊《Journal of the American Chemical Society》（JACS）发表了题为“Iterative enoyl reduction by a FabV-family enzyme expands the chemical landscape of discrete polyketide synthases”的研究论文。上海交通大学博士生高焱为本文第一作者，瞿旭东教授为通讯作者，本室为第一通讯单位。
08-22
2026
科研进展 | 开发新工具AlphaGEM，为非模式生物绘制精准“代谢地图”
近日，微生物代谢全国重点实验室鲁洪中课题组在国际期刊 《Nature Communications》发表了题为 “AlphaGEM Enables Precise Genome-Scale Metabolic Modelling by Integrating Protein Structure Alignment with Deep-learning-based Dark Metabolism Mining”的研究论文。该研究开发了自动化基因组规模代谢模型构建工具AlphaGEM。该工具创新性地整合了蛋白质三维结构比对、蛋白语言模型和深度学习功能注释，成功实现了跨真菌、细菌和哺乳动物的高质量、高通量代谢模型自动重构。AlphaFold初步解决了蛋白质3D结构预测的问题，AlphaGEM的推出则将非模式物种基因组规模代谢模型（ GEMs）的高质量重构向前推进了一大步。上海交通大学博士生韩伟赏、肖陆驰与本科毕业生孙浩成为该论文共同第一作者，鲁洪中副教授为唯一通讯作者，本室为第一通讯单位。
07-20
2026
