微生物代谢国家重点实验室学术交流例会2022-10

报告题目一:人工智能超级计算精准药物发现:抗衰老,癌症免疫与新冠

报告人: 魏冬青  长聘教授

报告摘要:

预测药物-靶标相互作用(DTI)是药物发现过程中必不可少的步骤。我们将DTI预测问题融入多标签学习框架中,用新型特征表示方法来提高准确度,开发了基于级联深林(CDF)的模型,此方法明显优于传统的基于整体学习的方法。为进一步提高预测性能,将社区检测方法引入多标签分类中预测DTI,并命名为DTI-MLCD。通过超大规模的高性能计算和虚拟筛选,我们发现花椒有效成分花椒素(WGX-50)可以通过激动α7乙酰胆碱能受体以及阻止β-amyloid聚集或使其解聚等途径,有效治疗老年痴呆症。除此之外,WGX-50的抗衰老功能在护肤品领域也得到了较好的应用。

此外,我们发现了中药有效成分山奈酚具有抗新型冠状病毒作用。通过超算筛选出一个新冠病毒的有效多肽抑制剂—人肠防御素5。该多肽抑制剂通过掩蔽人血管紧张素转化酶2(ACE2),抑制新冠病毒(SARS-CoV-2)突刺蛋白对人黏膜细胞的侵袭,从而阻断新冠病毒传染途径,并解释了为何病毒不通过消化系统传染。此发现被“Faculty Opinions”选作推荐论文,德国基尔大学的免疫学专家Jens-Michael Schröder教授进行点评,指出该工作给预防或治疗新冠肺炎提供全新途径。为此,魏冬青教授被评为上海市微生物学会“抗疫突出贡献优秀会员”。

 

报告题目二: 数据驱动的生物医学研究

报告人: 吕晖  特聘教授

报告摘要:

生物医学数据分析是保障精准医学实施的重要支撑。生物医学数据中组学数据来源多样,分析目的庞杂,数据格式繁多,分析软件达2.4万余个,工作流程爆炸式组合,对研究结果的可靠性和重复性提出了重大挑战。为应对这一挑战,提升临床和科研结果的客观性和科学性,我们构建了涵盖基因组、转录组、蛋白组、甲基化数据的生物医学大数据标准分析平台BMAP,并建立了严格的数据分析评价体系,为不同研究中组学数据分析可靠性、一致性提供了重要保障,并建立了适用于组学数据自动化分析流程的重要接口标准,为国内相关领域的建设提供了重要支撑平台。

 

主持人:邵文广 长聘教轨副教授

时   间:2022年10月18日(周二) 上午  10:00-11:10

地    点:腾讯会议

会议号:890 668 871

会议密码:221018

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