贺新义
Xinyi He
研究员
博士生导师
研究重点：
微生物DNA硫修饰的生理功能；核苷类活性天然产物生物合成
研究方向为微生物核酸修饰和次级代谢，研究内容包括：1）DNA硫修饰及识别；硫修饰生理功能；2）活性核苷类天然产物的生物合成和产业化研究。围绕以上内容，首次鉴定了硫原子识别结构域SBD，并阐明了识别机制；实现了基于SBD的核酸体外检测和RNA单碱基编辑。目前正在实验动物中研究DNA硫修饰微生物的生理功能。另一方面，对核苷类抗生素杀稻瘟菌素和米多霉素的生物合成途径进行了系统研究，在此基础上，提高了杀稻瘟菌素产量并实现企业转化。目前在构建低毒高效的米多霉素衍生物的高产菌株，有望实现其工业化生产，应用于防治小麦白粉病和黄瓜白粉病。主持多项国家自然科学基金, 上海市，企业委托开发项目，应邀为Nat Chem Biol, JACS等刊物审稿。授权发明专利3项。
教育经历
Educational experience
2003.04-2008.06 上海交通大学生命科学技术学院，博士学位
1998.09-2001.06 华中农业大学生命科学技术学院，硕士学位
1994.09-1998.06 华中农业大学食品科技系，学士学位
工作经历
Work experience
2015.01-至今 上海交通大学，生命科学技术学院, 研究员
2010.01-2014.12 上海交通大学，生命科学技术学院，副教授，副研究员
2012.08-2013.08 美国新英格兰生物实验室, 高级访问学者
2008.07-2008.10 英国莱斯特大学，医学院，访问学者
2007.07-2007.10英国莱斯特大学，医学院，访问学者
2001.09-2009.12 上海交通大学，生命科学技术学院，助教、讲师
荣誉获奖
Honours and Awards
2005 中国高校十大科技进展（第三）
2015 教育部自然科学一等奖（第四）
代表性论文
Representative works
1. Yuli Wang, Fulin Ge, Jinling Liu, Wenyue Hu, Guang Liu, Zixin Deng, Xinyi He*; The binding affinity-dependent inhibition of cell growth and viability by DNA sulfur-binding domains, Molecular Microbiology, 2024, 121(5): 971-983 ( *通讯作者 )
2. Wenyue Hu, Bingxu Yang, Qingjie Xiao, Yuli Wang, Yuting Shuai, Gong Zhao, Lixin Zhang, Zixin Deng, Xinyi He*, Guang Liu*, Characterization of a promiscuous DNA sulfur binding domain and application in site-directed RNA base editing, Nucleic Acids Research, 2023, 51(19): 10782 10794
3. Xiankun Wang, Yuchun Zhao, Yaojie Gao, Xiangkun Luo, Aiqin Du, Zixin Deng, Mark TM Zabriskie, Xinyi He*, Ming Jiang*. A [3Fe-4S] cluster and tRNA-dependent aminoacyl transferase BlsK in the biosynthesis of Blasticidin S. Proc Natl Acad Sci U S A. 2021 Jul 27;118(30):e2102318118.
4. Hao Yu, Jiayi Li, Guang Liu, Gong Zhao, Yuli Wang, Wenyue Hu, Zixin Deng, Geng Wu, Jianhua Gan, Yi-Lei Zhao*, Xinyi He*, DNA backbone interactions impact the sequence specificity of DNA sulfur-binding domains: revelations from structural analyses, Nucleic Acids Research, 2020, 48(15): 8755-8766
5. Guang Liu, Wencheng Fu, Zhenyi Zhang, Yao He, Hao Yu, Yuli Wang, Xiaolei Wang, Yi-Lei Zhao; Zixin Deng, Geng Wu*, Xinyi He*, Structural basis for the recognition of sulfur in phosphorothioated DNA, Nature Communications, 2018, 9(1): 4689
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