鲁洪中
Hongzhong Lu
长聘教轨副教授
博士生导师
研究重点：
细胞工厂数字建模与精准设计
鲁洪中，上海交通大学生命科学技术学院长聘教轨副教授，细胞数字建模课题组组长、独立PI、博导。长期从事于细胞代谢网络数字化建模，并将最新的多维细胞代谢模型应用于菌株智能设计和生物大数据分析等前沿领域。相关成果以一作或通讯作者发表于PNAS、Nat. Commun.、Mol. Syst. Biol.、Metab. Eng.、Brief. Bioinform.和Trends. Biotechnol.等国际知名期刊。
教育经历
Educational experience
2010.09-2016.06 华东理工大学，生物工程学院，生物化工专业，博士 (PhD)， 导师: 张嗣良教授和储炬教授
2006.09-2010.06 四川大学，化工学院，生物工程专业，本科 (Bachelor)
工作经历
Work experience
2021.09-至今 上海交通大学，生命科学技术学院，长聘教轨副教授、博导
2021.01-2021.09 瑞典，哥德堡大学，分子与临床医学学院，博士后(researcher)，合作导师: Prof. Fredrik Bäckhed
2017.09-2020.12 瑞典，查尔姆斯理工大学，生物工程与技术学院，博士后(post-doc), 合作导师: Prof. Jens Nielsen
2016.06-2017.08 帝斯曼集团 (上海)，助理科学家(Associate scientist)
代表性论文
Representative works
1. Haoyu Wang; Jens Nielsen; Yongjin J Zhou#; Hongzhong Lu#; Yeast adapts to diverse ecological niches driven by genomics and metabolic reprogramming, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2025, 122(32): e2502044122. (共同通讯作者)
2. Iván Domenzain; Yao Lu; Haoyu Wang; Junling Shi; Hongzhong Lu#Jens Nielsen#; Computational biology predicts metabolic engineering targets for increased production of 103valuable chemicals in yeast, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2025, 122(9): e2417322122. (共同通讯作者)
3. Chengyu Zhang; Benjamín J Sánchez; Feiran Li; Cheng Wei Quan Eiden; William T Scott; Ulf W Liebal; Lars M Blank; Hendrik G Mengers; Mihail Anton; Albert Tafur Rangel; Sebastián N Mendoza; Lixin Zhang; Jens Nielsen; Hongzhong Lu#; Eduard J Kerkhoven#; Yeast9: a consensusgenome-scale metabolic model for S. cerevisiae curated by the community, Molecular Systems Biology, 2024, 20(10): 1134-1150. (共同通讯作者)
4. Hongzhong Lu#; Luchi Xiao; Wenbin Liao; Xuefeng Yan; Jens Nielsen#; Cell factory design with advanced metabolic modelling empowered by artificial intelligence, Metabolic Engineering, 2024, 85: 61-72. (唯一第一作者, 共同通讯作者)
5. Tong Wang; Guangming Xiang; Siwei He; Liyun Su; Yuguang Wang; Xuefeng Yan; Hongzhong Lu#; DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures, Briefings in Bioinformatics, 2024, 25(5): bbae409. (独立通讯作者)
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