石婷
Shi Ting
研究员
博士生导师
叶杰全楼405
021-34207347
tshi@sjtu.edu.cn
研究重点: 微生物药物/计算生物学
长期从事计算化学、合成生物学、生物信息学等多学科交叉领域的科学研究,主持过科技部重点研发项目子课题、国家自然科学基金委项目以及企业开发项目等10余项。现致力于微生物药物代谢通路中的关键酶催化作用机制的解析,发展了能够快速分析酶结构-功能关系的“预反应态”模型,并在此基础上展开对酶-底物从识别、催化到释放的全过程模拟分析,为相关药物的研发和高效生产提供了新的理论基础。2025年合作成果发表在Cell上,在Nat Commun, ACS Catal, Acta Pharm Sin B,Catal Sci Tech等知名期刊发表SCI论文50多篇,授权国家发明专利2项。担任中国生物工程学会-计算生物学与生物信息学专业委员会委员、Current Chinese Science期刊的编委。
教育经历
Educational experience
1997.09-2001.07 西北大学,化学系,学士
2005.11-2007.01 北京大学深圳研究生院,化学生物学和生物技术学院,化学基因组学实验室,交流合作
2002.09-2007.07 西北大学,化学系,博士
工作经历
Work experience
2013.10-至今 上海交通大学生命科学技术学院 助理研究员,副研究员,研究员
2010.07-2013.10 上海交通大学基础医学院 助理研究员
2007.07-2010.07 中国科学院上海药物研究所 博士后
荣誉获奖
Honours and Awards
2023年,第八届全国大学生生命科学竞赛(指导教师)三等奖
2020年,第五届全国大学生生命科学竞赛(指导教师)三等奖
代表性论文
Representative works
1. Jiawei Wang; Xingyu Ouyang; Shiyu Meng; Bowen Zhao; Liangxu Liu; Chaofeng Li; Hengrun Li; Haotian Zheng; Yihan Liu; Ting Shi; Yi-Lei Zhao; Jun Ni*. Rational multienzyme architecture design with iMARS. Cell, 2025, 188(5), 1349-1362.
2. Yihan Liu#, Yongpeng Yao#, Kiran Siddique, Linquan Bai, Gang Liu*, Ting Shi*. Understanding and Engineering of C4 Indole Prenyltransferase FgaPT2 by Theoretical Study and Mutation Experiments. ACS Catalysis, 2025, 15(6), 4921-4933.
3. Xuefei Wang#, Zeqian Du#, Yuegui Guo#, Jie Zhong#, Kun Song, Junyuan Wang, Jianqiang Yu, Xiuyan Yang*, Chen-Ying Liu*, Ting Shi*, Jian Zhang*. Computer-aided molecular design and optimization of potent inhibitors disrupting APC‒Asef interaction. Acta Pharmaceutica Sinica B, 2024, 14(6), 2631e2645
4. Zeqian Du#, Yinhao Ma#, Yaoyao Shen#, Xuefeng Jiang*, Yongjun Zhou*, Ting Shi*. Exploring the substrate stereoselectivity and catalytic mechanism of non-ribosomal peptide macrocyclization in surugamides biosynthesis. iScience, 2024, 27, 108876.
5. Jialiang Wang#, Xiaojie Wang#, Xixi Li#, LiangLiang Kong#, Zeqian Du#, Dandan Li#, Lixia Gou, Hao Wu, Wei Cao, Xiaozheng Wang, Shuangjun Lin*, Ting Shi*, Zixin Deng*, Zhijun Wang*, Jingdan Liang*. C–N bond formation by a polyketide synthase. Nat Communication, 2023, 14, 1319.
6. Yuhuan Luo#, Zeqian Du#, Chenjian Jiang, Ziqian Yu, Jianjiang Zhong*, Ting Shi*, Han Xiao*. Rational engineering of a membrane-anchored promiscuous cytochrome P450 for the efficient biosynthesis of valuable ganoderic acids. ACS Catalysis, 2023, 13, 15673.
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