科研进展 | 本室童垚俊团队受邀在Natural Product Reports发表“卤代-脱卤”综述

近日,本室童垚俊团队(Microbial Synthetic Biology Lab, MiSynBio Lab)联合唐鸿志教授、白林泉教授和韩国KAIST的Sang Yup Lee院士等国内外环境微生物、天然产物、系统代谢工程及合成生物学领域优势团队受邀在国际天然产物领域权威综述期刊《Natural Product Reports》发表综述论文“Halogenases and Dehalogenases: Mechanisms,  Engineering, and Applications”。全面系统总结近五年领域内卤素酶与脱卤酶在天然产物合成、环境治理与合成生物学中的最新进展(全文共18个图、8个表、377篇参考文献)。本工作被审稿人评述为“首次提出卤化-脱卤闭环系统(halogenation-dehalogenation closed-loop system)”的概念,系统性地整合了卤素酶与脱卤酶的机制、工程与应用,为构建可持续生物催化体系提供了新的理论框架。

卤代有机化合物广泛存在于药物、农用化学品与先进材料中,卤素引入常常决定分子活性、代谢稳定性与给药性质;但传统化学卤化往往依赖强氧化剂与有毒卤源,条件苛刻、选择性受限且环境代价高。与此同时,持久性卤代污染物在环境中的累积又迫切需要高效、选择性的脱卤生物途径。因此,如何把“怎么构建(卤化)”与“如何回收/降解(脱卤)”统一到一个可编程的生物催化框架,已成为绿色合成与合成生物学的共同关切。

本综述围绕“从卤化到脱卤的全链路生物催化”这一主轴,系统梳理了三大类卤化机制(电亲性、自由基、亲核性)与主要脱卤路径(还原性、氧化性、水解性/脱卤素),并结合结构生物学、计算设计与蛋白工程的跨学科进展,讨论其在药物先导分子优化、绿色合成与污染物生物修复中的应用前景。文章亮点包括:

1. 提出闭环新范式

将卤化(构建C-X键)与脱卤(选择性去除X)统摄为合成-降解的可逆回路,为可控化学修饰、可逆代谢线路与可降解材料提供设计工具箱;

2. 工程策略成体系

从隧道工程、第二配位层重塑、定向进化与光/电耦合再生等角度归纳可迁移的工程方法学;

3.前沿酶种与非经典机制

关注铜依赖卤化酶、非载体自由基卤化酶、SAM-依赖亲核卤化等新兴体系,指出其在温和条件下实现位点与立体选择性C-H功能化的潜力;

4.资源型综述

覆盖最新文献与代表性案例,并以表格与示意图归纳适用底物范围、催化位点偏好与工程关键位点,为领域研究提供工具化、可检索的资料入口。

文章得到了审稿专家高度肯定(同行评审节选):“这是一篇非常出色的综述,总结了卤素化与脱卤化的历史与非常前沿的进展,结构平衡、内容权威,相当于两篇综述的价值。”、“该领域虽然有阶段性综述,但这篇最新、全面、时机恰当,过去几年内没有出现过如此综合性的工作。”、“文章覆盖Br、Cl、I以及相对独立的F,文献收录广泛(共377篇),写作风格清晰、权威。预期将成为经久耐读的经典综述,引用潜力可期。”、“首次系统性地整合卤化与脱卤两大反应类别,突出了它们在合成生物学闭环系统中的协同作用与潜在应用。”。

本综述潜在的学术与应用价值包括:

  1. 绿色合成的“生物方案”:替代传统卤化工艺中的强氧化剂/卤源与苛刻条件,以酶催化实现位点/区域/立体选择性修饰,适用于后期功能化与先导优化;

  2. 可编程代谢开关:在合成生物学回路中引入卤化/脱卤双向控制,实现可逆开关与闭环物质流(从合成到回收/降解),为药物工艺放大与可降解材料提供设计范式;

  3. 环境生物修复:系统总结OHRB(有机卤化物呼吸菌)与关键脱卤酶进展,指向标志酶/基因在原位监测与工程化去污中的应用。

上海交通大学罗晶博士为本综述第一作者。唐鸿志、白林泉和Sang Yup Lee为共同通讯作者,童垚俊为最后通讯作者。本工作得到国家重点研发(2021YFA0909500)、自然基金(32170080、32370026、32500035)、上海市“科技创新行动计划”合成生物学领域项目(24HC2810200)、上海交通大学“基础研发特区计划”(21TQ1400204)以及微生物代谢全国重点实验室开放课题、重点课题等多个基金资助。

文章链接:

https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2025/np/d5np00055f/unauth

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