科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 链霉菌调控因子转录的分子机制取得重要进展
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室郑舰艇课题组在《Nucleic Acids Research》上发表题为“Structural basis of Streptomyces transcription activation by zinc uptake regulator”的研究论文。该论文通过生化实验和冷冻电镜相结合,揭示了天蓝色链霉菌转录因子Zur通过与RNA聚合酶(RNAP)α亚基的碳端结构域(αCTD)互作激活锌外排蛋白编码基因zitB的转录,为理解Zur依赖的转录激活提供了基础。上海交通大学博士生杨旭为该论文第一作者,郑舰艇长聘副教授为通讯作者。
07-25
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 发展病原菌耐药移动元件的一键式分析软件
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室欧竑宇教授课题组在分子生物学知名刊物《Nucleic Acids Research》上发表题为“VRprofile2: detection of antibiotic resistance-associated mobilome in bacterial pathogens”的研究论文。该论文报道了病原菌耐药移动元件一键式分析的新软件VRprofile2,将有助于对多重耐药区形成机制的研究,为遏制细菌耐药性的传播提供新的思路。上海交通大学博士生王萌为该论文第一作者,欧竑宇教授为通讯作者。
05-08
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 植物病原黄单胞菌致病机制领域取得重要进展
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室何亚文教授课题组在《Phytopathology Research》发表了题为“黄单胞菌利用hca基因簇降解和利用宿主酚酸,增强致病力”(The phytopathogen Xanthomonas campestris scavenges hydroxycinnamic acids in planta via the hca cluster to increase virulence on its host plant)的研究文章。上海交通大学博士生陈博为第一作者,何亚文教授为通讯作者。此前,该项研究的姊妹篇“黄单胞菌利用反向转录的pobA/pobR位点感应和启动4-羟基苯甲酸降解,促进致病”(The phytopathogen Xanthomonas campestris utilizes the divergently transcribed pobA/pobR locus for 4-hydroxybenzoic acid recognition and degradation to promote virulence)发表于国际权威期刊《Molecular Microbiology》。
05-07
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 超级抗生素darobactin生物合成机制新发现
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室邓子新教授团队合作在《Nature Communications》发表了题为“Radical SAM-dependent ether crosslink in daropeptide biosynthesis”的研究论文,首次揭示了超级抗生素darobactin的双环形成机制。上海交通大学硕士生郭思佳和复旦大学博士后王舒为共同第一作者,丁伟副教授和复旦大学张琪教授为共同通讯作者。
05-01
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 硫修饰DNA的新型硫键在碘切反应和SBD蛋白识别中具有特殊意义
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授课题组分别在综合性权威杂志《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》和物理化学专业期刊《Physical Chemistry Chemical Physics》上发表了两篇关于硫修饰DNA中“硫-碘”强卤键和“硫-氮Pro”弱硫键的研究成果,题目分别为“Origin of iodine preferential attack at sulfur in phosphorothioate and subsequent P-O or P-S bond dissociation”(PNAS, 2022, 119(17):e2119032119)、“Molecular recognition between bacterial phosphorothioate DNA and sulfur-binding domain (SBD): competition |between the water cage and chalcogen-hydrophobic packet”(PCCP, 2022, 24: 9176 - 9187)。
04-21
2022