科研进展 | 发现芳香聚酮骨架的末端羧基编辑方式

近日,微生物代谢全国重点实验室瞿旭东团队在国际权威期刊《Journal of the American Chemical Society》(JACS)合作发表题为“Terminal Carboxyl Editing Drives Divergence in Fasamycin and Anthrabenzoxocinone Biosynthesis”的研究成果。上海交通大学博士后姜凯为本文的第一作者,瞿旭东教授和罗树坤博士为共同通讯作者,本室为第一单位。

芳香聚酮作为一大类具有重要生物活性的天然产物,其生物合成主要由II型聚酮合成酶(PKSs)负责,催化丙二酰辅酶A发生脱羧克莱森缩合,生成碳原子数为16至30的偶数碳链。随后,芳构化酶/环化酶(ARO/CYC)控制碳链折叠形成基本的偶数碳芳香骨架。这些骨架作为母核,经过进一步的PKS后修饰,产生复杂多样的聚酮结构。然而,尽管存在多种偶数碳基本骨架,奇数碳芳香聚酮仍广泛存在,而末端羧基的去留决定了最终产物的碳数和结构。因此,聚酮碳链末端羧基的机制解析,对于扩展芳香聚酮的结构多样性和功能多样性至关重要。

(+)/(−)-Anthrabenzoxocinones(ABXs)和Fasamycin(FAS)是一类对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和耐万古霉素屎肠球菌(VRE)具有高效活性的II型聚酮化合物。它们具有非平面、手性的25碳结构,源于一个共同的26碳前体——化合物1(图1)。近期课题组已阐明该前体涉及的两条合成路径:其一,在独特的ARO/CYC FasU催化下,经历一步酶促脱羧环化步骤,形成FAS的轴手性联苯结构(E环)(J Am Chem Soc, 2025, 147, 5596-5601);其二,该前体末端脱羧形成phenyldimethylanthrone(PDA)(Proc Natl Acad Sci USA, 2024, 121, e2321722121),随后PDA通过双氧杂Diels-Alder反应转化为(−)-ABX的手性氧桥结构(E环)(Nat Chem, 2025, 17, 1058-1066)。然而,该前体的不稳定性使得生物合成途径更为复杂:化合物1能自发脱羧形成PDA,或自发环化产生副产物fasamycin F(FAS-F)。对于FAS的生产,稳定前体对于避免脱羧至关重要;而对于ABX的合成,则需要快速脱羧以防止FAS-F的形成。这种微妙的平衡暗示存在一种精密的末端羧基编辑机制。

图1  II型芳香聚酮ABX和FAS的生物合成途径分化过程

在本研究中,联合课题组首先在体外研究了FAS途径中单加氧酶家族蛋白FasS以及ABX途径中SchA/CurD家族蛋白AbxO的功能。通过调节体外酶反应体系温度,并结合脱羧环化酶FasU组合催化,发现FasS作为首个羧基保护蛋白保护化合物1的末端羧基,使其允许FasU的后续环化。相反,AbxO作为首个线性末端聚酮链脱羧酶,负责化合物1脱羧产生PDA,这是ABX形成的关键中间体。系统发育分析和功能研究证实,FasS和AbxO与广泛分布但功能未知的WhiE-ORFI家族蛋白的N端和C端密切相关。为深入理解FasS独特的羧基保护机制和AbxO的脱羧机制,联合课题组又解析了FasS、AbxO和WhiE-ORFI的晶体结构。通过对FasS和AbxO活性位点的定点突变,揭示了关键的功能残基。对FasS进一步的ITC测试,并结合分子动力学模拟(MD)分析,表明了FasU和FasS之间的相互作用促进了化合物1的解离过程。

本研究工作不仅首次揭示了II型聚酮生物合成中隐秘的末端羧基编辑方式,也为未来产生新型奇数碳芳香聚酮骨架提供了重要思路。

图2  AccS(FasS同源蛋白)、Abx(+)O和WhiE-ORFI的晶体结构及其底物结合和催化机制

 

该研究工作获到国家自然科学基金(32425033,22377074,22107069)、上海市优秀学术带头人项目(22XD1421300)以及上海市自然科学基金项目(23ZR1432800)的支持。

论文链接:

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5c06089

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