科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 揭秘深海热液古菌细菌共同祖先的代谢特征
近日,本室肖湘教授课题组与自然科学研究院洪亮教授团队合作,以分离培养深海热液超嗜热古菌和嗜热细菌为切入点,首次应用高通量蛋白结构组研究早期生命代谢,揭示了深海热液古菌细菌共同祖先的代谢特征。该研究成果以“Proteome-wide 3D structure prediction provides insights into the ancestral metabolism of ancient archaea and bacteria”为题,发表在国际权威杂志《Nature Communications》。上海交通大学生命科学技术学院赵维殳助理研究员与自然科学研究院本科生钟博子韬为本文的共同第一作者,肖湘教授和洪亮教授为共同通讯作者。
12-22
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 阐明非血红素铁双加氧酶NicX的催化机理
近日,本室唐鸿志教授课题组和赵一雷教授课题组在《Chem Catalysis》合作发表了题为“Dioxetane and Lactone Pathways in Dioxygenolytic Ring Cleavage Catalyzed by 2,5-Dihydroxypyridine Dioxygenase”的研究论文。本研究阐明了一种新型非血红素铁酶NicX利用其独特的铁催化中心活化氧气分子,以罕见的retro-[2+2]开环降解底物芳香环的反应机制。上海交通大学博士生欧阳兴宇为第一作者,唐鸿志教授和赵一雷教授为共同通讯作者。
12-20
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 成功分离皂化废水处理中的难培养关键微生物
近日,本室唐鸿志教授课题组在Cell Press旗下《The Innovation》发表了题为“Community-integrated multi-omics facilitates screening and isolation of the organohalide dehalogenation microorganism”的研究论文。本研究多维度分析了工业废水处理中关键微生物的功能潜力及潜在需求,并成功分离了辅助污染物降解的难培养关键微生物,为后续污染物降解关键微生物资源库的拓展提供基础。上海交通大学博士生黄逸群为第一作者,唐鸿志教授为通讯作者。
12-20
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 合作阐明细菌保护自身硫修饰基因组的分子机理
近日,本室吴更教授团队与武汉大学陈实、王连荣教授团队合作阐明了细菌利用DndFGH复合物限制外源细菌非硫修饰DNA侵染,保护自身硫修饰基因组的分子机理。该研究成果以“The functional coupling between restriction and DNA phosphorothioate modification systems underlying the DndFGH restriction complex”为题发表在《Nature Catalysis》期刊。吴更教授与陈实、王连荣教授为并列通讯作者。
12-11
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 细菌六型分泌系统高质量数据分析新工具
近日,我室欧竑宇研究组在生物学专业期刊《Science China Life Sciences》发表了题为“SecReT6 update: a comprehensive resource of bacterial Type VI Secretion Systems”的研究论文。该研究更新了细菌六型分泌系统开放数据库SecReT6,提供了六型分泌系统的高质量数据和新分析工具。
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