科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 发现转录新生RNA的动态变化
近日,本室刘昱团队和自然科学研究院洪亮团队合作在国际权威杂志《Nature Communications》上发表了题为“Observation of structural switch in nascent SAM-VI riboswitch during transcription at single-nucleotide and single-molecule resolution”的研究论文。该研究阐明了S-腺苷甲硫氨酸-VI型核糖开关RNA (riboSAM)的共转录结构特征,首次捕获到transit结构,并提出了riboSAM的转录共折叠模型。上海交通大学博士生薛燕燕和李俊为该论文共同第一作者,刘昱研究员和洪亮教授为共同通讯作者。
05-08
2023
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 揭示全球范围内转座噬菌体多样性及生态功能
近日,国际微生物生态学领域权威期刊《The ISME Journal》在线发表了本室蹇华哗研究员带领的深海病毒研究组(DVRT)最新研究成果“Unexplored diversity and ecological functions of transposable phages”。上海交通大学博士生张慕杰为论文第一作者,蹇华哗研究员为通讯作者。
04-20
2023
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 揭示植物病原菌拮抗活性物吡唑三嗪生物合成与调控机制
近日,本室陈功友教授团队在国际权威杂志《Nature Communications》上发表了题为“The natural pyrazolotriazine pseudoiodinine from Pseudomonas mosselii 923 inhibits plant bacterial and fungal pathogens”的研究论文,揭示了摩氏假单胞菌923菌株产生天然抗生素吡唑三嗪pseudoiodinine的生物合成与调控机制。上海交通大学博士后杨瑞环和石清为论文的共同第一作者,陈功友教授和农业与生物学院邹丽芳副教授为共同通讯作者。
02-10
2023
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 揭秘深海热液古菌细菌共同祖先的代谢特征
近日,本室肖湘教授课题组与自然科学研究院洪亮教授团队合作,以分离培养深海热液超嗜热古菌和嗜热细菌为切入点,首次应用高通量蛋白结构组研究早期生命代谢,揭示了深海热液古菌细菌共同祖先的代谢特征。该研究成果以“Proteome-wide 3D structure prediction provides insights into the ancestral metabolism of ancient archaea and bacteria”为题,发表在国际权威杂志《Nature Communications》。上海交通大学生命科学技术学院赵维殳助理研究员与自然科学研究院本科生钟博子韬为本文的共同第一作者,肖湘教授和洪亮教授为共同通讯作者。
12-22
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 阐明非血红素铁双加氧酶NicX的催化机理
近日,本室唐鸿志教授课题组和赵一雷教授课题组在《Chem Catalysis》合作发表了题为“Dioxetane and Lactone Pathways in Dioxygenolytic Ring Cleavage Catalyzed by 2,5-Dihydroxypyridine Dioxygenase”的研究论文。本研究阐明了一种新型非血红素铁酶NicX利用其独特的铁催化中心活化氧气分子,以罕见的retro-[2+2]开环降解底物芳香环的反应机制。上海交通大学博士生欧阳兴宇为第一作者,唐鸿志教授和赵一雷教授为共同通讯作者。
12-20
2022
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