科研进展 ｜ 微生物代谢国家重点实验室 细菌六型分泌系统高质量数据分析新工具
近日，我室欧竑宇研究组在生物学专业期刊《Science China Life Sciences》发表了题为“SecReT6 update: a comprehensive resource of bacterial Type VI Secretion Systems”的研究论文。该研究更新了细菌六型分泌系统开放数据库SecReT6，提供了六型分泌系统的高质量数据和新分析工具。
11-14
2022
科研进展 ｜ 微生物代谢国家重点实验室 微生物组工程理论及其在环境领域的应用与展望
近日，我室唐鸿志教授课题组在《mLife》上在线发表了题为“Guided by the principles of microbiome engineering: Accomplishments and perspectives for environmental use”的综述文章。该文回顾了近年来微生物组工程理论方面的前沿研究，以及在环境领域中的经典应用，并对未来的研究思路进行了展望。上海交通大学助理研究员胡海洋与苏黎世联邦理工学院博士后王淼啸为文章共同第一作者，唐鸿志教授与北京大学聂勇副研究员为共同通讯作者。
11-14
2022
科研进展 ｜ 微生物代谢国家重点实验室合作成果 DNA硫化修饰激活细菌抵御噬菌体侵染功能
近日，国际权威期刊《Nature Communications》发表了我室吴更教授团队合作研究论文“Nicking mechanism underlying the DNA phosphorothioate-sensing antiphage defense by SspE”。该研究阐明了链霉菌等细菌通过DNA上的磷硫酰化修饰激活其SspE蛋白的核酸酶活性，对侵入的噬菌体DNA进行缺刻，从而抵抗噬菌体侵染。吴更教授与武汉大学王连荣教授、陈实教授为共同通讯作者。
11-12
2022
科研进展 ｜ 微生物代谢国家重点实验室 开发非天然底物结合适配策略进化氨基转移酶高效合成井冈霉烯胺
近日，我室冯雁教授分子酶学与合成生物学研究室在国际知名期刊《ACS Catalysis》上发表了题为“Molecular Evolution of an Aminotransferase Based on Substrate–Enzyme Binding Energy Analysis for Efficient Valienamine Synthesis”的研究论文。该研究提出了一种针对非天然小分子底物井冈霉烯酮在目标转氨反应候选酶RffA_Kpn大结合口袋中的半理性进化方法，有效提升了候选氨基转移酶催化设计底物井冈霉烯酮合成井冈霉烯胺的能力。我室崔莉副研究员为论文通讯作者。
11-07
2022
科研进展 ｜ 微生物代谢国家重点实验室 解析新颖二聚化氨甲酰基转移酶晶体结构及催化机制
近日，上海交通大学微生物代谢国家重点实验室白林泉教授课题组在国际权威期刊《Nature Communications》上在线发表了题为“Endowing homodimeric carbamoyltransferase GdmN with iterative functions through structural characterization and mechanistic studies”的研究论文。该研究聚焦安莎类药物（安丝菌素和格尔登素）生物合成后修饰中新颖二聚化氨甲酰基转移酶，细致解析了其蛋白的催化机制，实现了对酶功能的迭代氨甲酰化重塑。我室博士研究生韦建华和厦门大学张璇博士为论文第一作者，白林泉教授和康前进副研究员为共同通讯作者。
11-06
2022
