科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 开发非天然底物结合适配策略进化氨基转移酶高效合成井冈霉烯胺
近日,我室冯雁教授分子酶学与合成生物学研究室在国际知名期刊《ACS Catalysis》上发表了题为“Molecular Evolution of an Aminotransferase Based on Substrate–Enzyme Binding Energy Analysis for Efficient Valienamine Synthesis”的研究论文。该研究提出了一种针对非天然小分子底物井冈霉烯酮在目标转氨反应候选酶RffA_Kpn大结合口袋中的半理性进化方法,有效提升了候选氨基转移酶催化设计底物井冈霉烯酮合成井冈霉烯胺的能力。我室崔莉副研究员为论文通讯作者。
11-07
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 解析新颖二聚化氨甲酰基转移酶晶体结构及催化机制
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室白林泉教授课题组在国际权威期刊《Nature Communications》上在线发表了题为“Endowing homodimeric carbamoyltransferase GdmN with iterative functions through structural characterization and mechanistic studies”的研究论文。该研究聚焦安莎类药物(安丝菌素和格尔登素)生物合成后修饰中新颖二聚化氨甲酰基转移酶,细致解析了其蛋白的催化机制,实现了对酶功能的迭代氨甲酰化重塑。我室博士研究生韦建华和厦门大学张璇博士为论文第一作者,白林泉教授和康前进副研究员为共同通讯作者。
11-06
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 肺癌口腔微生物组的宏蛋白质组学新策略
近日,综合性科技期刊《Research》发表了上海交通大学微生物代谢国家重点实验室肖华课题组与合作者的研究论文《肺癌口腔微生物组的宏蛋白质组学深度分析》(In-Depth Metaproteomics Analysis of Oral Microbiome for Lung Cancer)。该研究创建了宏蛋白质组学研究新策略,为深入探究微生物组与疾病的关系提供了新工具。上海交通大学博士毕业生姜晓腾和药学院张岩副教授为该论文共同第一作者,肖华教授、电子信息与电气工程学院曹成喜教授、美国加州大学洛杉矶分校胡深教授为共同通讯作者。
10-26
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 联合发表“群体感应信号DSF介导的种内、种间和跨界信号交流”综述文章
近日,国际微生物学权威综述期刊《Trends in Microbiology》在线发表了上海交通大学微生物代谢国家重点实验室何亚文教授团队的综述文章“DSF家族群体感应信号介导的种内、种间和跨界信号交流(DSF-family quorum sensing signal-mediated intraspecies, interspecies, and inter-kingdom communication)”。何亚文教授为文章第一作者和通讯作者,中山大学邓音乐教授、新加坡南洋理工大学缪岩松教授(Prof. Yansong Miao)为文章共同第一作者。
09-28
2022
科研进展 | 微生物代谢国家重点实验室 综述多环氧杂蒽酮天然产物生物合成研究进展
近日,上海交通大学微生物代谢国家重点实验室唐鸿志课题组在《mLife》上发表题为“Unveiling degradation mechanism of PAHs by a Sphingobium strain from a microbial consortium”的研究论文。该课题组通过10余年的努力挖掘,获得一株高效多环芳烃降解菌株并详细阐述了其分子机理,为环境特殊底盘的开发打下坚实的基础。上海交通大学博士生张莉鸽为该论文第一作者,唐鸿志教授为通讯作者。
09-28
2022